微生物资源对促进可持续农业发展具有巨大的潜力。微生物既是调控土壤健康质量、增加土壤肥力的重要抓手;也是农业减排降碳、改善土壤生态的有力贡献者，在农产品工厂化生产方面也具有相当的优势。
今年两会，全国政协委员、红杉中国创始及执行合伙人沈南鹏带来了《发掘农业微生物应用潜力，推动绿色高效现代农业建设的提案》。
“在农业微生物应用方面，当前还存在一些短板有待补齐：一是农业生物资源开发重‘动植物’，轻‘微生物’;二是农业微生物菌种保藏有待加强，作为市场主体的微生物企业研发投入不足;三是受制于成本和肥效稳定性等因素，微生物肥料的市场接受度落后于化肥、农药等化学品。”沈南鹏表示。
充分发掘农业微生物的应用潜力，对推进高产优质、绿色高效现代农业具有重要作用。沈南鹏建议：
一、加强农业微生物学科研突破，拓展专项支持范围。建立跨学科农业微生物学实验室，支持微生物学、遗传学、基因组学、农学等科研人员共同开展农业微生物应用基础研究;推动形成饲料发酵、农业废弃物无害利用、土壤改良和污染防治等子专项，资助相关领域微生物资源发掘利用研究。
二、加大微生物产品应用推广和固碳菌株研发支持。依托基层农技推广机构和服务组织，通过将微生物肥料列为主推技术示范任务、开展田间效果试验讲解等方式，加强微生物产品的应用宣传推广;菌种选育优先支持促进固碳功能的关键菌株挖掘利用;加大对可用于食物和饲料的微生物蛋白质生产技术的长期研发支持，逐步降低畜牧业产生的温室气体排放。
三、政企共建充实菌种保藏力量，以资源摸底和知识产权保护促开发利用。参照深圳国家基因库政企合作经验，建议国家以容量、技术设施等标准遴选一批具有成熟保藏条件的企业，通过政府购买服务或补贴形式，共建新型菌种保藏库;建议农业农村部制定更全面的农业微生物资源目录并更新发布，为研究各种农业微生物相互作用与发挥效能提供基础支持;优化农业微生物专利菌株鉴定方法和侵权判定标准，明晰基因序列相似程度达到何种比例即可认定为同一种微生物，加强创新菌株保护。
四、优化财税和肥效评价政策，“肥药双减”缓解对土壤微生物的伤害。参考生物有机肥免征增值税先例，将生物菌、土壤修复剂等纳入免征增值税范围;设立微生物肥料分级补助制度，根据微生物肥料中化肥占比不同分级给予补贴;进一步完善微生物肥料肥效评价体系，将有效活菌进入土壤后定殖性、抗逆性、增产效果等纳入生物肥料标准体系;加速推动高毒农药全面退市，研究扩大限制使用农药品种和使用场景。
