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世界首款柑橘液相芯片“橘芯1号”出自西部(重庆)科学城

2024-04-22 09:59:46
来源:重庆高新区 作者:王柯岚 评论:0
  育种芯片是生物育种体系中种质资源基因型检测的重要工具,在农作物遗传改良和生物育种研究中发挥重要作用。为提高柑橘育种效率、加快柑橘育种进程,开发一款经济、高效的基因分型芯片十分必要。

  入驻西部(重庆)科学城种质创制大科学中心的柑橘团队、国家柑橘品种改良中心研制的首款柑橘液相育种芯片——“橘芯1号”,近期获得国家发明专利授权。

  柑橘团队成员、西南大学柑桔研究所副教授李强表示,由于柑橘多年生、童期长,加之遗传背景杂合、某些品种间杂交不亲和等原因,用传统方式育种,若想得到一个优良品种的种质资源需要30年以上。育种芯片为构建包括柑橘全基因组选择育种在内的柑橘生物育种平台奠定坚实的基础;它具有分子精准化设计、高通量、低成本、智慧化等特点,可显著提高柑橘育种效率,大幅度缩短育种周期。

  回看长达近7年的研发之路,团队成员都觉得虽然苦,但值得。据了解,柑橘团队负责人、西南大学柑桔研究所所长陈善春带领团队以国家柑橘种质资源圃300多个代表性柑橘品种为材料,通过深度重测序筛选出4万余个核心SNP位点。同时,加入了数千个与柑橘重要性状紧密关联的SNP位点,利用靶向捕获技术开发了柑橘全基因组40K液相育种芯片,即“橘芯1号”。

  “橘芯1号”的最大优势就在于,能够低成本、高通量地进行柑橘基因分型,进一步为资源鉴定、全基因组关联、遗传分析等提供基因组学资源。应用场景多,如,可用于鉴定种质资源的基因型,并全基因组关联分析,获取重要性状关联的分子标记和功能基因,用于分子标记分子育种和分子育种;以及鉴定种质资源的基因型,建立全基因组选择模型,用于全基因组选择育种;对种质资源材料进行精准的基因型鉴定,用于种质资源鉴定和遗传多样性分析。

  当前,西部(重庆)科学城正聚焦“4+1+X”现代化产业体系,依托全区科技创新资源集聚优势,围绕种质创制、数字生物育种、种质资源圃建设等核心技术攻关,强化顶尖人才培育和产业转化功能,努力建成一流装备、一流技术、一流团队、一流产出、一流应用的“5个一流”西部农业之“芯”。

  在这片生生不息的土地上,种质创制大科学中心不仅要打好“组合拳”,锻造“中国芯”,为保障国家粮食安全与生物安全贡献智慧和力量,还将聚力打造开放性科研平台,强化校地校企合作,联合攻关,着力打通产学研用全过程链条,实现创新链与产业链深度融合,努力把中心建设成为西部(重庆)科学城科技人才集聚地,科技创新发源地和新兴产业策源地,通过成果转化运用促进产业转型升级,服务国家战略和地方发展需求。

(图片来源:重庆高新区)

(责任编辑:陈楠)

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